Вопрос создания медицинского центра на базе ЕрФИ начал обсуждаться еще лет 10 назад. В 2004 г. на проведенном у министра экономики К.Чшмаритяна совещании, где обсуждались возможности диагностики и лучевой терапии онкологических больных с использованием протонного циклотрона, присутствовал известный российский ученый из Объединенного института ядерных исследований в Дубне Юрий Оганесян, который активно поддержал эту идею.

В 2010 году было принято решение правительства РА о создании центра "Армбиотехнология" в составе НАН. В объединенный научный центр во главе с академиком Ашотом Сагияном вошли бывший Институт биотехнологии Министерства экономики, а также Институт микробиологии и Центр депонирования микроорганизмов НАН, прежде располагавшиеся в г.Абовяне. Приватизации, к которой в течение 10 лет принуждало Институт биотехнологии Министерство экономики РА, наконец удалось избежать, но новый статус потребовал серьезных преобразований и немалых усилий. Два научных учреждения пришлось перебрасывать из Абовяна в Ереван, обустраивать в здании Института биотехнологии, создавать новую административную и научную структуру. Был организован объединенный научный совет, новые исследовательские подразделения. Преобразования требовали и серьезных затрат. Стояла задача обеспечить условия для научной работы, соответствующие европейским стандартам.